farsi dei pezzetti spingendo in piedi sui pedali può capitare e non è normale che per questo nascano dei dolori... a meno di avere una qualche patologia al ginocchio, oppure di pedalare male quindi sforzando in modo sbagliato le articolazioni, oppure avendo un allenamento approssimativo e quindi le articolazioni, non essendo abituate a quello sforzo, possono sovra-affaticarsi.
Tieni in considerazione che non sono un ortopedico, poi non so quanti anni hai, nè di quale entità/tipologia di dolore parliamo, l'unica cosa pedala tranquillo, magari caricando progressivamente di uscita in uscita per migliorare la tenuta delle gambe, ma se il dolore persiste rivolgiti ad uno specialista, magari passando prima da un biomeccanico che ti sistemi per benino in sella.